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武漢貝科新肽科技有限公司
主營：原位雜交,亞細(xì)胞定位,蛋白互作,啟動子篩選
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直接法
將標(biāo)記的特異性熒光，直接加在抗原標(biāo)本上，經(jīng)一定的溫度和時間的染色，用水洗去未參加反應(yīng)的多余熒光，室溫下干燥后封片、鏡檢。
間接法
如檢查未知抗原，先用已知未標(biāo)記的特異（）與抗原標(biāo)本進(jìn)行反應(yīng)，用水洗去未反應(yīng)的，再用標(biāo)記的抗（第二）與抗原標(biāo)本反應(yīng)，使之形成—抗原—復(fù)合物，再用水洗去未反應(yīng)的標(biāo)記，干燥、封片后鏡檢。如果檢查未知，則表明抗原標(biāo)本是已知的，待檢為，其它步驟的抗原檢查相同。
蛋白質(zhì)序列特征：
利用改進(jìn)型偽氨基酸組成法（PseAAC）、偽位置特異性得分矩陣法（PsePSSM）和三聯(lián)體編碼法（CT）對蛋白質(zhì)序列進(jìn)行特征提取，并將這三種方法得到的特征向量進(jìn)行融合，以得到一個全新的蛋白質(zhì)序列特征表達(dá)模型，然后輸入到堆棧式降噪自編碼器（SDAE）深度網(wǎng)絡(luò)里自動學(xué)習(xí)更有效的特征表示，選用 Softmax 回歸分類器進(jìn)行亞細(xì)胞的分類預(yù)測，可有效提高蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位預(yù)測的準(zhǔn)確性。
利用 PSI-BLAST 工具搜索蛋白質(zhì)序列，提取位點特異性譜中的位點特異性得分矩陣作為蛋白質(zhì)的一類特征，并計算 4 等分序列的氨基酸含量以及 1～7 階二肽含量作為另外兩類特征，實時熒光定量，由這三類特征一共得到蛋白質(zhì)序列的 12 個特征向量。通過設(shè)計一個簡單加權(quán)函數(shù)對各類特征向量加權(quán)處理，作為神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預(yù)測器的輸入，可提高蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位預(yù)測的精度。
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第3年
